Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368 ms