Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms