Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COG3Q96JB2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG3Q96JB2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms