Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMP4Q96G21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms