Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTP4Q96DX8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms