Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1AQ96CP6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRAMD1AQ96CP6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms