Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF25Q93038 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms