Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms