Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms