Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms