Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms