Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYDE1Q6ZW31 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms