Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms