Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA5Q6Q788 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
APOA5Q6Q788 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms