Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms