Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6GQU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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