Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HP1BP3Q5SSJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms