Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms