Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms