Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms