Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN20Q4JDL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms