Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS72Q15906 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
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