Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1AQ15573 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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