Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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