Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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