Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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