Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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