Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms