Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM27E3Q08E93 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms