Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHRNDQ07001 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNDQ07001 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms