Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms