Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 TYS1YGR185C 1185 nt2.59□□□□□ -1.99
UPS3Q04006 SPO12YHR152W 522 nt2.59□□□□□ -1.99
UPS3Q04006 SNL1YIL016W 480 nt2.59□□□□□ -1.99
UPS3Q04006 RIB4YOL143C 510 nt2.59□□□□□ -1.99
UPS3Q04006 DNM1YLL001W 2274 nt2.59□□□□□ -1.99
UPS3Q04006 YAT2YER024W 2772 nt2.59□□□□□ -2
UPS3Q04006 RTK1YDL025C 1863 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 UBP14YBR058C 2346 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 DRS2YAL026C 4068 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 ERV14YGL054C 417 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 CLC1YGR167W 702 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 PXR1YGR280C 816 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 RPS21BYJL136C 264 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 OST6YML019W 999 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 SSO2YMR183C 888 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 TAF3YPL011C 1062 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 YPR077CYPR077C 372 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 YPR150WYPR150W 522 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 GPI13YLL031C 3054 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 ALG1YBR110W 1350 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 TEC1YBR083W 1461 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 ISM1YPL040C 3009 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 REC8YPR007C 2043 nt2.58□□□□□ -2
UPS3Q04006 ESL1YIL151C 3357 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YDR149CYDR149C 708 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YIL175WYIL175W 318 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 ECM4YKR076W 1113 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 YMR141CYMR141C 309 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 NCE103YNL036W 666 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 CWC25YNL245C 540 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 MCK1YNL307C 1128 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 NEM1YHR004C 1341 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 SUP45YBR143C 1314 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 FLO11YIR019C 4104 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 FBP26YJL155C 1359 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 BNA4YBL098W 1383 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 SER3YER081W 1410 nt2.57□□□□□ -2
UPS3Q04006 CHS2YBR038W 2892 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 FRE2YKL220C 2136 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 FUN30YAL019W 3396 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 ISW2YOR304W 3363 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 INP52YNL106C 3552 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 FMC1YIL098C 468 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 ATP12YJL180C 978 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 MRPL20YKR085C 588 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 YLR230WYLR230W 306 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 YNL320WYNL320W 855 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 SIL1YOL031C 1266 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 YOL079WYOL079W 399 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 YOR238WYOR238W 912 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 ANT1YPR128C 987 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 MUM3YOR298W 1440 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 PGS1YCL004W 1566 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 MRH4YGL064C 1686 nt2.56□□□□□ -2
UPS3Q04006 SLH1YGR271W 5904 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 CWC2YDL209C 1020 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 MOB2YFL034C-B 864 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 ERJ5YFR041C 888 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 ERD2YBL040C 660 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 RNY1YPL123C 1305 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 RPL19AYBR084C-A 570 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 RAD5YLR032W 3510 nt2.55□□□□□ -2
UPS3Q04006 UTP25YIL091C 2166 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 YFL040WYFL040W 1623 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 SPO77YLR341W 1434 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 MGA1YGR249W 1371 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 RCR2YDR003W 633 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 COS8YHL048W 1146 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 VPS21YOR089C 633 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 RIB5YBR256C 717 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 KIN82YCR091W 2163 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 RSN1YMR266W 2862 nt2.54□□□□□ -2
UPS3Q04006 EPO1YMR124W 2832 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 YFL051CYFL051C 483 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 CPR7YJR032W 1182 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 AHP1YLR109W 531 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 CPR8YNR028W 927 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 HUT1YPL244C 1020 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 SHE3YBR130C 1278 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 SKN7YHR206W 1869 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 CEX1YOR112W 2286 nt2.53□□□□□ -2
UPS3Q04006 YDL176WYDL176W 2127 nt2.53□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 SLM2YNL047C 1971 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 POL31YJR006W 1464 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 RPA190YOR341W 4995 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 CHO2YGR157W 2610 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 PEX10YDR265W 1014 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 YAR069CYAR069C 294 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 CPR3YML078W 549 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 TMA108YIL137C 2841 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 ATG13YPR185W 2217 nt2.52□□□□□ -2.01
UPS3Q04006 RAX2YLR084C 3663 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms