Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms