Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P58686 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P58686 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P58686 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P58686 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P58686 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P58686 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P58686 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P58686 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms