Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA9P57773 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA9P57773 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA9P57773 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA9P57773 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA9P57773 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA9P57773 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA9P57773 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA9P57773 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA9P57773 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA9P57773 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA9P57773 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA9P57773 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA9P57773 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA9P57773 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA9P57773 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA9P57773 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms