Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX4P57082 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX4P57082 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX4P57082 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX4P57082 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX4P57082 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX4P57082 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX4P57082 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX4P57082 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX4P57082 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX4P57082 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX4P57082 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX4P57082 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX4P57082 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX4P57082 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX4P57082 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms