Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms