Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTSWP56202 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSWP56202 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSWP56202 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSWP56202 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSWP56202 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTSWP56202 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSWP56202 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSWP56202 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSWP56202 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTSWP56202 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTSWP56202 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTSWP56202 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTSWP56202 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSWP56202 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTSWP56202 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTSWP56202 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTSWP56202 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTSWP56202 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTSWP56202 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms