Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms