Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPP55072 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPP55072 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCPP55072 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPP55072 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPP55072 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPP55072 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPP55072 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPP55072 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPP55072 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPP55072 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms