Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCAR3P49019 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms