Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms