Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX1P40424 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX1P40424 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX1P40424 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms