Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL4P36578 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL4P36578 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL4P36578 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL4P36578 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL4P36578 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL4P36578 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL4P36578 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL4P36578 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL4P36578 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL4P36578 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL4P36578 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms