Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPB2P35606 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPB2P35606 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPB2P35606 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPB2P35606 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPB2P35606 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPB2P35606 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPB2P35606 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms