Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPD1P23109 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms