Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP8P22894 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP8P22894 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP8P22894 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP8P22894 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms