Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPCAMP16422 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPCAMP16422 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms