Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFXP16104 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms