Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL5P13501 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL5P13501 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL5P13501 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL5P13501 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL5P13501 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL5P13501 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL5P13501 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL5P13501 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL5P13501 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms